Şeref MALKOÇ Trabzon'da doğdu. İlk, orta ve lise eğitimini Trabzon'da tamamladı.
1982 yılında İstanbul Üniversitesi Hukuk Fakültesi'nden mezun oldu. Trabzon'da 10 yıl avukatlık ve bir çok STK'da yöneticilik yaptı. 20. ve 21. Dönem Trabzon Milletvekilliği yaptı. TBMM Adalet Komisyonu Sözcüsü, Anayasa Komisyonu Başkanvekilliği görevlerinde bulundu. Refah Partisi ve Fazilet Partisi kapatma davalarının savunmasını hazırlayarak bu partileri Anayasa Mahkernesi'de savundu. 54. Hükümetinin Başbakanı Prof. Dr. Necmettin ERBAKAN' a 10 yıla yakın danışmanlık yaptı.
Çeşitli ulusal ve yerel radyo ve TV kanallarında yöneticilik yapan Sn. MALKOÇ, Adalet ve Kalkınma Partisini Yüksek Seçim Kurulunda iki yıl temsil etti. Anayasa ve Başkanlık Sistemi ile ilgili yazı ve makaleleri çeşitli dergi ve gazetelerde yayımlandı. "40 Soruda Yeni Anayasa ve Başkanlık Sistemi" adlı kitabı bulunan MALKOÇ, Cumhurbaşkanımız Recep Tayyip ERDOĞAN' in Başdanışmanlığı görevinde bulundu.
15 Kasım 2016 tarihinde TBMM Genel Kurulu tarafından Kamu Başdenetçisi olarak seçildi. Bu görevi 4 (dört) yıl sürdürdükten sonra 11 Kasım 2020 tarihinde yeniden Türkiye Kamu Başdenetçisi olarak seçildi. Şeref MALKOÇ, 2019-2024 yılları arasında İslam İşbirliği Teşkilatı Ombudsmanlar Birliği ve Türk Devletleri Ombudsmanlar ve Ulusal İnsan Hakları Kurumları Birliği Başkanlığını yaptı.
Evli ve 3 evlat sahibidir.